Una nova tècnica permet classificar de manera automàtica i fiable les soques de Staphylococcus aureus associats a infeccions hospitalàries

Un estudi liderat pel Dr. Ignasi Roca, investigador d'ISGlobal, i la Dra. Mª Ángeles Domínguez, de l'Hospital Universitari de Bellvitge, desenvolupa un protocol automatitzat, simple i ràpid per classificar soques de Staphylococcus aureus resistents a la meticilina. El protocol, publicat a la revista Clinical Microbiology and Infection, està basat en una tècnica particular d'espectrometria de masses i podrà implementar-se en laboratoris de rutina.

El Staphylococcus aureus resistent a la meticilina (SARM) és un dels patògens que més infeccions hospitalàries causa i aquestes infeccions solen tenir el seu origen en un limitat nombre de soques o variants genètiques. Des del punt de vista terapèutic i epidemiològic, és important poder identificar localment les soques dominants de SARM, però els mètodes moleculars d'identificació que s'usen actualment són cars, laboriosos i requereixen de personal altament qualificat.

Recentment s'ha començat a utilitzar una tècnica particular basada en l'espectrometria de masses (MALDI-TOF/MS) per identificar aïllats clínics bacterians a nivell d'espècie. Aquesta tècnica té, a més, el potencial per discriminar entre diferents subespècies, identificar variants genètiques i rastrejar brots infecciosos. Tot i això, totes les estratègies de MALDI-TOF/MS publicades fins avui per discriminar mostres bacterianes més enllà del nivell d'espècie necessiten una interpretació manual dels espectres per personal especialitzat en aquestes anàlisis.

Per aquesta raó, els autors de l'estudi van avaluar la possibilitat d'usar un protocol automatitzat de MALDI-TOF/MS per discriminar entre les principals soques de SARM que circulen a l'Hospital Universitari de Bellvitge. Partint de 82 aïllats clínics de SARM representant els quatre llinatges (o complexos clonals, CC) principals, els autors van analitzar els espectres de cada aïllat i van identificar pics específics per a cada CC. La posterior creació d'un protocol específic de tipificació al programari d'anàlisi, que pondera de manera específica la presència/absència d'aquests pics, va permetre l'automatització del procés. Encara que la interpretació automatitzada dels pics va ser una mica menys sensible que la supervisada, va aconseguir classificar als aïllats en les seves CC corresponents amb un valor predictiu del 98,9%. Els autors conclouen que aquesta metodologia simple i automatitzada representa una eina poderosa i fiable per a la tipificació d'aïllats clínics de S. aureus, la qual cosa permetrà implementar les mesures adequades de control per limitar la seva transmissió i estudiar la dinàmica de poblacions del SARM. De manera important, aquesta tècnica pot implementar-se en laboratoris de rutina que ja realitzen la identificació bacteriana per espectrometria de masses.

Referència

Camoez M, Sierra JM, Dominguez MA, Ferrer-Navarro M, Vila J, Roca I. Automated categorization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus clinical isolates into different clonal complexes by MALDI-TOF mass spectrometry.Clin Microbiol Infect. 2015 Oct 23.